對於有報道指政府不應「一刀切」向所有強制隔離人士收費，政府在3月16日澄清，並無此安排。
當局留意到，有懷疑濫用暫住設施的情況，例如有香港居民在強制檢疫措施於2月8日生效後多次往返內地，重複入住暫住設施；亦有香港居民在有本地居所的情況下，仍然堅持入住暫住設施。有見及此，政府將由3月17日起，向入住暫住設施的人士收費，以打擊濫用情況及把宿位留給真正有需要的人士。
政府指，收費安排不適用於入住檢疫中心人士，即與確診患者有密切接觸，或由湖北省等健康風險較高地區抵港但沒有出現病徵的人士。因此，從鑽石公主號或湖北返港的人士入住檢疫中心，毋須付費。
政府表示，收費安排只適用於入住政府暫住設施，即曹公潭戶外康樂中心、西貢戶外康樂中心或麥理浩夫人度假村的人士。他們都是從國內除湖北省以外返港的本港居民，本應在家居，或其自行安排的處所進行家居隔離。
